Die Bedienung des Klinikinformationssystems muß dem Personal beigebracht werden. Zur Zeit gibt es wenig medizinisches Personal mit tiefergehenden EDV-Kenntnissen, weshalb großer Schulungsbedarf besteht. Dazu muß eine zentrale Stelle wie das Klinikrechenzentrum regelmäßig Kurse für das Personal durchführen und im Stil einer Hotline auch kurzfristig per Telefon oder Electronic Mail und anderen elektonischen Kommunikationswegen für Rückfragen und zur Problemberatung zur Verfügung stehen. Da bei den Problemen lebensbedrohliche Situationen auftreten können, müssen rund um die Uhr Experten für die Software zur Verfügung stehen.
Regelmäßige Schulungen werden in Deutschland bei der Planung von EDV-Projekten meistens übersehen und entsprechendes Personal viel zu spät von Schulungsunternehmen hinzugezogen. Dies ist beim Klinikinformationssystem inakzeptabel, da erhebliche Teile des Systems aus Speziallösungen bestehen und zum Teil auch Spezialkenntnisse erfordern. Spezielles Schulungspersonal ist also unumgänglich.